Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms