Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLTPD2A6NH11 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms