Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U3KPZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U3KPZ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U3KPZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U3KPZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U3KPZ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U3KPZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U3KPZ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U3KPZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U3KPZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U3KPZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U3KPZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U3KPZ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U3KPZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U3KPZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
U3KPZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U3KPZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U3KPZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U3KPZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U3KPZ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U3KPZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U3KPZ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U3KPZ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U3KPZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U3KPZ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U3KPZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U3KPZ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms