Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23IPQ9Y6Y8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC23IPQ9Y6Y8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms