Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MAP3K4Q9Y6R4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
MAP3K4Q9Y6R4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms