Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA3Q9Y6H8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJA3Q9Y6H8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA3Q9Y6H8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms