Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC6Q9Y625 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC6Q9Y625 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms