Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUBP2Q9Y5Y2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUBP2Q9Y5Y2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms