Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4S1Q9Y587 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms