Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00588Q9Y4M8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00588Q9Y4M8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms