Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KIF3AQ9Y496 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF3AQ9Y496 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms