Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms