Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAB39Q9Y376 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAB39Q9Y376 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAB39Q9Y376 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms