Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms