Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM2AQ9Y2K7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM2AQ9Y2K7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms