Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC5A6Q9Y289 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC5A6Q9Y289 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC5A6Q9Y289 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC5A6Q9Y289 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC5A6Q9Y289 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC5A6Q9Y289 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC5A6Q9Y289 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms