Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF3IP3Q9Y228 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAF3IP3Q9Y228 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms