Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB2Q9UPW6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB2Q9UPW6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms