Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRPK3Q9UPE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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