Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFR2Q9UP52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFR2Q9UP52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms