Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCG2Q9UNQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCG2Q9UNQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms