Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPIEQ9UNP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPIEQ9UNP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPIEQ9UNP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms