Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS4AQ9UN37 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS4AQ9UN37 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS4AQ9UN37 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms