Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX12Q9UMY4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX12Q9UMY4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms