Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO1Q9UM00 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO1Q9UM00 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms