Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV5

HSF4, Heat shock factor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4Q9ULV5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF4Q9ULV5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSF4Q9ULV5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms