Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPCN1Q9ULQ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TPCN1Q9ULQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
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