Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT6Q9ULM6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms