Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMKLBQ9ULI2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMKLBQ9ULI2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms