Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSEQ9UL01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms