Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDV3Q9UKY7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDV3Q9UKY7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms