Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC9Q9UKV0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC9Q9UKV0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms