Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms