Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RCAN3Q9UKA8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms