Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms