Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC5Q9UII4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms