Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL3Q9UH77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL3Q9UH77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms