Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRF1LQ9UGC7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms