Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPASTQ9UBP0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms