Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL42Q9P2K6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL42Q9P2K6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms