Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC47.51■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
CCDC180Q9P1Z9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC47.5■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC47.47■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.19
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC47.38■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC47.38■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CCDC180Q9P1Z9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC47.3■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms