Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4Q9P0V3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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