Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP1Q9NZI2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP1Q9NZI2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms