Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PODXL2Q9NZ53 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PODXL2Q9NZ53 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms