Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CWC25Q9NXE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC25Q9NXE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms