Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3BQ9NW08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3BQ9NW08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3BQ9NW08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms