Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC11Q9NVH1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC11Q9NVH1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms