Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD4Q9NVD3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms