Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT13Q9NUP7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT13Q9NUP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT13Q9NUP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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