Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPRMQ9NS64 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms